同时日本的药品价格体系一直以来也不断暴露出诸多问题，如药价长期处于一种不透明、不公正的状态。为了解决该问题，日本医药产业为与国际化相适应，由日本公正交易委员会发动了对医药流通体制及药价方面的改革，到1986年实现了医药分家。

    以上措施直接促使流通环节的改善，市场集中度逐步提高。日本前三大批发企业的市场集中度1995-2005年十年间从21%提高到67%。

    鼓励创新的产业政策：为医药产业的腾飞奠定了基础

    翻开日本医药产业的腾飞的历史，我们不难发现“创新”贯穿于产业发展的各阶段，这与日本政府其在鼓励创新上的产业政策的指引有着密不可分的关系。我们把其对产业的影响大致分为三个阶段：

    技术引进阶段：日本采取专利蚕食政策“学而超之”

    从50年代起，日本开始引进大量先进的专利技术，仅1950-1970年，购进专利技术达1万多项，耗资21.5亿美元，加上推广的研究经费总计约为60亿美元，而其他国家用于发明这些专利费用总额约1800-2000亿美元，是日本引进和推行专利费用的30余倍。在这20年的时间里，日本工业产值增长的30%来自专利技术，这部分产值相当于购买专利技术所花费用的10倍。日本引进专利技术时，其引进不是单独的引进，其模仿也不是单独的模仿，而是在引进、模仿的同时，运用自己的才智，不断的加以更新、改进，从而围绕外国的基本专利，衍生出许多带有日本特色的小专利，亦称从属专利或依从专利，人称“蚕食政策”。这种明智的引进、这种聪明的模仿，不仅成功地促使了日本经济的高速增长，而且使日本成为世界公认的专利大国之一，日益积累的巨大专利数反过来又为日本成为世界经济大国奠定了雄厚的基础。

    自主开发阶段：由“技术引进依赖”转向“模仿性创新”

    进入二十世纪七十年代，世界经济走向低迷，特别是1973年10月第四次中东战争爆发引起的石油危机，更是使象日本这样能源依赖进口的国家受到很大的打击。另一方面，药品管理法全面改革，主要由于人们开始对新药的安全性和有效性开始质疑。新的药品管理法对新药的报批有着更多和更严格的限制，使得本来就很难的新药开发更是难上加难，全球进入了短暂的新药空白时代，过去还主要依赖国外引进的日本在这一时期也不得不转向自主研发。不仅如此，1976年专利法依照国际惯例修订，由制造法专利转变为药品专利，再靠仿制国外药品己经是不可行的办法。而从另一个角度来看，自主研制新药又会得到很好的保护。因而，在早期本来就己经奠定了不错的研发能力基础上，日本的医药产业从这一时期开始由依赖型全面转入自主型开发时代。新药的模仿性创新，既利用专利保护制度保护了自己的知识产权，又打破了他人利用专利在该领域形成的垄断，同时又降低了新药研发的风险也为技术领先性创新做了必要的技术积累，有利于民族医药工业的发展。

    日本在新药自主开发阶段，医药产业整体的研发水平有了长足的进步。自主开发的新药数量明显上升，从1970年的13个，上升到1987年的25个，但是由于日本在自主开发时期选择模仿性创新的策略，因此在新药R&D水平的评价标准方面，还是比美国略逊一筹，日本的新药主要为D类新药。(注：NCES划分为四类。

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