经过数年的努力，农学部和一些研究机构相继成立，学校规模有了很大的发展，学生人数成倍增加，京都第三高中并入后，以此为基础成立了人文学部，后发展成为今天的教养学部。战后，按照新的教育法，全部实行新制，削去帝国大学中的“帝国”二字，清除军国主义对京都大学的破坏和影响，包括实行男女共学，清理教师队伍，废除一些不合时宜的讲座，增设教育学部、药学部和一些研究所，研究生的教育得到了长足发展，对外开放门户。这样，就成了在日本仅次于东京大学的学科齐全、规模宏大的国立综合大学。

　　京都大学是一所国立大学，基本上由国家拨款，办学经费充足，自创收入亦很可观。在1989-1990年度，共支出798多亿日元，其中用于人员支出近419多亿日元，用于设备材料等支出近380亿日元。学校各项收入来源有：大学医院服务146亿元；学生学费收入56亿多日元；其他收入33亿日元。另外还有科学研究补助费43亿多日元。

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